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Translating gene lists into biological insights...
 


User data and parameters: User data: textAreaUpload.txt, Organism: hsapiens, Id Type: ensembl_gene_stable_id, Ref Set: entrezgene, Significance Level: .05, Statistics Test: Hypergeometric, MTC: BH, Minimum: 2

This table lists the enriched transcription factor targets (TFT), number of Entrez IDs in your user data set for the TFT, the corresponding Entrez IDs, and the statistics for the enriched TF.
The statistic column lists:
Finally, the number of user gene ids is linked to a table with information about the user ids, and the Entrez IDs are linked to Entrez Gene.

TFT #Gene EntrezGene Statistics
hsa_GGGCGGR_V$SP1_Q6 58 9670 7317 115704 118881 9322 322 57410 4810 29924 27129 1389 65056 22933 1780 1482 154007 65992 2314 55182 57103 81562 55229 84922 10209 9053 5499 10574 23139 8241 6642 201895 7709 51107 84315 3326 81858 7332 617 9525 131474 23513 2794 9528 7422 3757 84759 27436 55677 9148 10910 27095 112936 10806 2547 55012 3145 84232 9869 C=2891;O=58;E=19.57;R=2.96;rawP=7.63e-14;adjP=3.36e-11
hsa_TGACCTY_V$ERR1_Q2 26 7317 118881 55324 9322 79724 5245 10904 27129 6535 5585 84334 80045 10999 2805 27112 84893 6609 131474 7422 9148 1994 6508 27254 148252 2101 7167 C=1023;O=26;E=6.93;R=3.75;rawP=1.04e-08;adjP=2.29e-06
hsa_ACTAYRNNNCCCR_UNKNOWN 16 9670 10067 9322 22933 81490 4294 22907 6642 23583 51107 84315 81858 5905 10806 84232 27352 C=444;O=16;E=3.01;R=5.32;rawP=8.04e-08;adjP=1.18e-05
hsa_SCGGAAGY_V$ELK1_02 26 7317 11267 29924 54949 22933 64777 8533 81605 10574 22907 6642 10726 23583 51300 3326 51163 9528 84759 22827 10910 29101 51264 221785 55012 6949 9869 C=1176;O=26;E=7.96;R=3.27;rawP=1.61e-07;adjP=1.78e-05
hsa_CAGGTG_V$E12_Q6 40 9670 10067 9322 1950 54949 1389 65056 5585 1482 9491 2314 3705 653121 55182 57103 81562 1612 80045 6367 9053 27112 3815 54897 3326 81858 57140 2794 5905 3757 84759 51657 27436 9148 23640 112936 221785 1855 2063 84232 1487 C=2450;O=40;E=16.59;R=2.41;rawP=2.56e-07;adjP=2.26e-05
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hsa_V$E2F1_Q3_01 10 54949 26001 5499 1209 147929 9341 22827 57161 1633 3145 C=245;O=10;E=1.66;R=6.03;rawP=7.65e-06;adjP=0.0004
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hsa_GGGAGGRR_V$MAZ_Q6 34 115704 9322 64837 322 54890 29924 54949 1389 65056 5585 23382 55182 8533 84922 10209 2805 5499 27112 54926 201895 7709 54897 80318 3326 7332 11277 3757 7422 27095 10806 27254 2101 7167 79901 C=2250;O=34;E=15.23;R=2.23;rawP=1.14e-05;adjP=0.0005
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hsa_V$HSF_Q6 8 54890 65056 3303 5481 10209 3326 3304 23640 C=196;O=8;E=1.33;R=6.03;rawP=6.25e-05;adjP=0.0018
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hsa_V$COUP_DR1_Q6 8 79724 9491 6760 81562 54926 11277 2063 2101 C=246;O=8;E=1.67;R=4.80;rawP=0.0003;adjP=0.0046
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hsa_V$E2F_03 6 54949 26001 147929 9341 22827 1633 C=243;O=6;E=1.65;R=3.65;rawP=0.0065;adjP=0.0484
hsa_V$E2F_Q2 5 23139 51107 9341 10806 375035 C=173;O=5;E=1.17;R=4.27;rawP=0.0067;adjP=0.0484
hsa_V$ATF3_Q6 6 65056 10209 3326 133015 2794 84557 C=245;O=6;E=1.66;R=3.62;rawP=0.0067;adjP=0.0484
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WebGestalt is currently developed and maintained by Jing Wang and Bing Zhang at the Zhang Lab. Other people who have made significant contribution to the project include Dexter Duncan, Stefan Kirov, Zhiao Shi, and Jay Snoddy.

Funding credits: NIH/NIAAA (U01 AA016662, U01 AA013512); NIH/NIDA (P01 DA015027); NIH/NIMH (P50 MH078028, P50 MH096972); NIH/NCI (U24 CA159988); NIH/NIGMS (R01 GM088822).